Intel, Lenovo и BGI Genomics (китайская корпорация, специализирующаяся на науках о жизни и геномике) объявили, что три компании сотрудничают в целях ускорения анализа геномных характеристик нашумевшего коронавируса SARS-CoV-2. Эксперты в области технологий и медико-биологических наук из Intel и Lenovo будут работать вместе, чтобы поддержать исследователей BGI с помощью новейших технологий анализа больших данных и вычислительных ресурсов, – это расширит возможности инструментов секвенирования и позволит более эффективно анализировать геномные характеристики коронавируса.
Технология, которую Intel и Lenovo предоставили BGI, включает большой кластер HPC для обработки высокопроизводительных операций чтения из секвенсора BGI DNBSEQ-T7. Это поможет ученым исследовать вирулентность, схемы передачи патогена и взаимодействия между хозяином и патогеном, что послужит основой для исследований в области эпидемиологии и разработки вакцин. В результате этой работы BGI надеется оптимизировать свои диагностические наборы COVID-19, получить множество знаний о вирусе, ускорить разработку эффективной вакцины или других защитных мер вроде иммунотерапии.
“Есть еще много аспектов, которые мы не знаем о коронавирусе. Поскольку BGI Genomics работает над геномным анализом вируса и для ускорения идентификации инфекции, эти усилия требуют огромных вычислительных ресурсов. И именно здесь мы можем поделиться своим опытом”, – отметил вице-президент группы по продажам, маркетингу и коммуникациям Intel Руи Ван.
“Вспышка коронавирусной пневмонии затронула сердца всей страны. Lenovo стремится предоставлять вычислительную поддержку для исследований в области биологических наук, – добавил старший вице-президент Lenovo Фуяо Тонг. – Эксперты в области анализа больших данных и наук о жизни из Intel и Lenovo объединят наши ресурсы и опыт, помогут решить критические проблемы и будут способствовать развитию здравоохранения и наук о жизни”.
При секвенировании генома нужно учитывать, что 1 мл телесной жидкости обычно содержит миллионы различных вирионов; каждый вирион, в свою очередь, имеет геном примерно с 30000 оснований ДНК или “букв”. Учитывая, что BGI секвенирует пробы микроорганизмов у многих пациентов с подозрением на инфекцию, работа будет генерировать данные объемом от терабайт до петабайт. Для эффективной обработки такого массива важной информации требуется более совершенная инфраструктура высокопроизводительных вычислений, вычислительные технологии и оптимизированные методы аналитики генома. (3dnews.ru/Машиностроение Украины и мира)